Desde un inicio el CIES ha recibido el apoyo básico de la Agencia Canadiense para el Desarrollo Internacional (ACDI) y del Centro Internacional de Investigaciones para el Desarrollo (IDRC). Asimismo, cuenta o ha contado con la colaboración del Banco Central de Reserva del Perú, Banco Interamericano de Desarrollo, Banco Mundial, Fundación Ford, OXFAM, PNUD, Proyecto CRECER-USAID, Superintendencia de Banca y Seguros, CARE Internacional, Agencia Española de Cooperación Internacional (AECI), La Defensoría del Pueblo y el Ministerio de Economía y Finanzas.
